Geopark Karavanke je organiziran kot EZTS Evropsko združenje za teritorialno sodelovanje Geopark Karavanke. Evropsko združenje za teritorialno sodelovanje (EZTS) je instrument EU, ustanovljen za spodbujanje čezmejnega, transnacionalnega in medregionalnega sodelovanja, ki je enako zastopano na obeh straneh meje. Ima lastno pravno osebnost in je zato samostojen nosilec pravic in obveznosti (100-odstotna javna institucija) ter omogoča upravljanje čezmejnih ali medregionalnih projektov trajnostnega razvoja.
Župan Dr. Tomaž Rožen, Občina Ravne na Koroškem, predsednik
Županja Elisabeth Lobnik, Tržna občina Železna Kapla-Bela/Eisenkappel-Vellach, podpredsednica
Županja mag. Romana Lesjak, Občina Črna na Koroškem
Župan dr. Matija Tasič, Občina Prevalje
Župan Bernhard Sadovnik, Občina Globasnica/Globasnitz
Župan Hermann Srienz, Tržna občina Bistrica nad Pliberkom/Feistritz ob Bleiburg